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http://hdl.handle.net/10071/32919
Author(s): | Bairros, Rita Seixas |
Advisor: | Brandão, Tomás Gomes Silva Serpa Elvas, Luís Manuel Nobre de Brito |
Date: | 5-Nov-2024 |
Title: | Deep learning-based calcium scoring of the aortic valve using 3D TEE: Preliminary study |
Reference: | Bairros, R. S. (2024). Deep learning-based calcium scoring of the aortic valve using 3D TEE: Preliminary stud [Dissertação de mestrado, Iscte - Instituto Universitário de Lisboa]. Repositório Iscte. http://hdl.handle.net/10071/32919 |
Keywords: | Echocardiography Aortic stenosis Calcium scoring Deep learning Processamento de imagens -- Image processing Ecocardiografia Estenose aórtica Quantificação de cálcio |
Abstract: | Aortic stenosis is a critical cardiovascular condition that can be assessed through
echocardiography, with calcium deposits on the aortic valve playing a key role in diagnosis.
This dissertation presents a hybrid approach combining deep learning and image processing
methods to improve the detection and quantification of aortic valve calcifications. Two main
objectives were addressed: (1) detecting and extracting the image region corresponding to the
aortic valve, and (2) quantifying calcium deposits within the segmented valve, correlating these
results with Agatston scores derived from CT scans. An adapted YOLOv8n model was
employed for valve detection, achieving 99.94% precision, 81.82% recall, and a mean Average
Precision (mAP) of 92.88%. The region of interest was successfully extracted in all cases using
a combination of manual annotations and automated segmentation techniques. For calcium
scoring, two approaches were explored: a heuristic method and convolutional neural network
(CNN) models. The CNN models captured complex patterns in the echocardiographic images,
with the fine-tuned ResNet50 model demonstrating superior performance, achieving a mean
absolute error of 1356.56. The heuristic method showed a Pearson correlation of 0.75 with the
CT-derived Agatston score, validating its accuracy, especially in patients with higher calcium
scores. Additionally, a gender-based analysis revealed that male patients exhibited higher
calcium deposits, consistent with existing cardiovascular research. This work shows that
combining deep learning with traditional methods can improve the diagnostic process for aortic
stenosis, offering potential for timely, precise diagnoses and advancing healthcare system
efficiency. Os depósitos de cálcio na válvula aórtica são um fator crucial no diagnóstico da estenose aórtica, uma condição cardiovascular crítica. Nesta dissertação, propõe-se uma abordagem híbrida que combina técnicas de deep learning com processamento de imagem para melhorar a identificação e quantificação das calcificações na válvula aórtica. Foram estabelecidos dois objetivos principais: (1) detetar e extrair a região da imagem correspondente à válvula aórtica, e (2) quantificar os depósitos de cálcio na válvula segmentada, correlacionando os resultados com os scores de Agatston obtidos em TACs. O modelo YOLOv8n foi adaptado para a deteção da válvula, atingindo 99,94% de precisão, 81,82% de recall e mAP de 92,88%. A extração da região de interesse foi bem-sucedida, utilizando segmentação manual e automática. Para quantificação de cálcio, foram exploradas duas abordagens: uma heurística e CNNs, com a ResNet50 ajustada mostrando erro absoluto médio de 1356,56. A precisão do método heurístico foi validada, especialmente em pacientes com scores de cálcio mais elevados, através de uma correlação de Pearson de 0,75 com os scores de Agatston derivados das TACs. Além disso, uma análise com base no género revelou que os pacientes do sexo masculino apresentavam níveis mais elevados de depósitos de cálcio, em linha com estudos anteriores na área cardiovascular. Este trabalho demonstra como a integração de deep learning e técnicas convencionais pode otimizar o diagnóstico da estenose aórtica, contribuindo para diagnósticos mais rápidos e precisos. |
Department: | Departamento de Ciências e Tecnologias da Informação |
Degree: | Mestrado em Sistemas Integrados de Apoio à Decisão |
Peerreviewed: | yes |
Access type: | Open Access |
Appears in Collections: | T&D-DM - Dissertações de mestrado |
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